GROMACS-2020.2 버전 설치 소개 (SKL)
슈퍼컴퓨팅인프라센터 2020. 6. 26. 13:44
KISTI 누리온 시스템에서 SKL 계산노드용 gromacs-2020.2 버전 실행 파일을 컴파일 하는 예시입니다.
가. 설치 환경
구분
내용
대상 시스템
누리온
OS Version
리눅스 / CentOS 7.9
CPU
Intel(R) Xeon(R) Gold 6148
컴파일러
Intel 2019.5 Version
MPI
IntelMPI 2019.5 Version
기타
Intel Math Kernel Library (MKL)
나. 설치 전 환경 설정
KISTI 누리온시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules이 구성되어 있습니다. 이하 설치 예시 에서는 module load를 이용하여 설치 진행합니다.
[ 환경 설정 ]
다. gromacs-2020.2 버전 설치 과정
설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.
[설치과정]
※ "-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${HOME}/GROMACS/2020.2"는 예시로 설치 희망하는 디렉토리로 명시한다.
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