# GROMACS-5.1.4 설치

KISTI 누리온 시스템에서 gromacs-5.1.4 버전 실행  파일을 컴파일 하는 예시입니다.

## **가. 설치 환경**

| **구분**     | **내용**                          |
| ---------- | ------------------------------- |
| 대상 시스템     | 누리온                             |
| OS Version | 리눅스 / CentOS 7.9                |
| CPU        | Intel(R) Xeon(R) Gold 6148      |
| 컴파일러       | Intel 2018.3 Version            |
| MPI        | IntelMPI 2018.3 Version         |
| 기타         | Intel Math Kernel Library (MKL) |

## **나. 설치 전 환경 설정**

KISTI 누리온시스템은 PATH, LD\_LIBRARY\_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules이 구성되어 있습니다. 이하 설치 예시 에서는 module load를 이용하여 설치 진행합니다.

\[ 환경 설정 ]

<pre class="language-shell-session"><code class="lang-shell-session"><strong>$ module purge
</strong><strong>$ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3
</strong></code></pre>

## **다. gromacs-5.1.4 버전 설치 과정**

설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략합니다.

\[설치과정]

```shell-session
$ export CC=mpiicc
$ export CXX=mpiicpc
$ export CPATH=/apps/compiler/intel/18.0.3/mkl/include:$CPATH
$ tar xvzf gromacs-5.1.4.tar.gz
$ cd gromacs-5.1.4
$ mkdir build
$ cd build
$ cmake -DBUILD_SHARED_LIBS=OFF -DGMX_FFT_LIBRARY=mkl \
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=${HOME}/GROMACS/5.1.4 \
-DGMX_MPI=ON -DGMX_OPENMP=ON -DGMX_CYCLE_SUBCOUNTERS=ON \
-DGMX_GPU=OFF -DGMX_BUILD_HELP=OFF -DGMX_HWLOC=OFF
..
$ make
$ make install
```

<mark style="color:blue;">※ "-DCMAKE\_INSTALL\_PREFIX=${HOME}/GROMACS/5.1.4"는 예시로 설치 희망하는 디렉토리로 명시</mark>