# GROMACS-2021.4 버전 설치 소개 (SKL)

KISTI 누리온 시스템에서 SKL 계산노드용 gromacs-2021.4 버전 실행  파일을 컴파일 하는 예시입니다.

## **가. 설치 환경**

| **구분**     | **내용**                          |
| ---------- | ------------------------------- |
| 대상 시스템     | 누리온(SKL)                        |
| OS Version | 리눅스 / CentOS 7.9                |
| CPU        | Intel Xeon 6148                 |
| 컴파일러       | Intel 2021.4 Version            |
| MPI        | IntelMPI 2021.4 Version         |
| 기타         | Intel Math Kernel Library (MKL) |

***

## **나. 설치 전 환경 설정**

KISTI 누리온시스템은 PATH, LD\_LIBRARY\_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules이 구성되어 있습니다. 이하 설치 예시 에서는 module load를 이용하여 설치 진행합니다.

\[ 환경 설정 ]

<pre class="language-shell-session"><code class="lang-shell-session"><strong>$ module purge
</strong><strong>$ module intel/oneapi_21.2 impi/oneapi_21.2 cmake/3.12.7
</strong></code></pre>

***

## **다. gromacs-2021.4 버전 설치 과정**

설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법 등 진행 절차를 위주로 설명하고,\
소스 파일 다운로드 등은 생략합니다.

\[설치과정]

```shell-session
$ export FLAGS="-O2 -g -static-intel"
$ export CFLAGS=$FLAGS
$ export CXXFLAGS=$FLAGS
$ export CC=mpiicc
$ export CXX=mpiicpc


$ tar -xzvf gromacs-2021.4.tar.gz
$ cd gromacs-2021.4/
$ mkdir build
$ cd build


$ cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/GROMACS/2021.4 \
- DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DGMX_MPI=ON -DGMX_OPENMP=ON \
- DGMX_CYCLE_SUBCOUNTERS=ON -DGMX_GPU=OFF -DGMX_HWLOC=OFF \
- DGMX_SIMD=AVX_512 \
- DGMX_OPENMP_MAX_THREADS=32


$ make
$ make install
```

※ <mark style="color:blue;">**"-DCMAKE\_INSTALL\_PREFIX=$HOME/GROMACS/2021.4**</mark><mark style="color:blue;">"</mark>는 예시로 설치 희망하는 디렉토리로 명시