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활용정보
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  • 활용정보
  • 1️⃣소프트웨어 설치
    • 누리온
      • LAMMPS
        • lammps-2Aug2023 설치 소개
        • lammps-3Mar20 설치 소개(SKL)
        • lammps-3Mar20 설치 소개(KNL)
        • lammps-12Dec18 설치 소개
      • GROMACS
        • GROMACS-2021.4 버전 설치 소개 (SKL)
        • GROMACS-2021.4 버전 설치 소개 (KNL)
        • GROMACS-2020.2 버전 설치 소개 (KNL)
        • GROMACS-2020.2 버전 설치 소개 (SKL)
        • GROMACS-2018.6 버전 설치 소개 (KNL)
        • GROMACS-2018.6 버전 설치 소개 (SKL)
        • GROMACS-5.1.4 설치
      • Quantum Espresso
        • Quantum Espresso-7.2 설치 소개
        • Quantum Espresso-6.6 설치 소개
        • Quantum Espresso-6.2.1 설치 소개
      • OpenFOAM
        • OpenFOAM-v1912 설치 소개
        • OpenFOAM-v1712 설치 소개
        • OpenFOAM-7 버전 설치 소개(SKL)
        • OpenFOAM-7 버전 설치 소개(KNL)
        • OpenFOAM-5.x 버전 설치 소개(SKL)
        • OpenFOAM-5.x 버전 설치 소개(KNL)
      • VASP
        • VASP 6.5.0 설치 소개
        • VASP 6.1.0 설치 소개
        • VASP 5.4.4 설치 (KNL)
        • VASP 5.4.4 설치 (SKL)
        • VASP 5.3.5 설치
      • 누리온 R-3.6.2 버전 설치 소개
      • CP2K
        • CP2K-6.1.0 버전 설치 소개
        • CP2K-5.1.0 버전 설치 소개
      • SIESTA
        • SIESTA 4.1-b3 설치(KNL)
        • SIESTA 4.1-b3 설치(SKL)
      • WRF-V3.9.1.1 설치
      • RASPA v2.0.47 설치 소개
      • gcc v8.1.0 설치
      • UPP v3.1 설치 소개
      • mpiP v3.4.1 설치 소개
      • V_Sim v3.7.2 설치 소개
      • foam-extend v3.1 설치 소개
      • ParaView v5.2.0 설치 소개
      • AutoDock Vina v1.1.2 설치 소개
      • DDSCAT v7.3.3 설치 소개
    • 뉴론
      • VASP
        • VASP 6.4.3 설치 (GPU)
        • VASP 5.4.4 설치 (GPU)
      • GROMACS
        • GROMACS-2018.6 (GPU 버전) 설치
        • GROMACS-2016.4 (GPU 버전) 설치
      • LAMMPS
        • lammps-16Mar18 (GPU 버전) 설치
      • NAMD 2.12 (GPU 버전) 설치
      • Quantum Espresso
        • Quantum Espresso-7.3 (GPU 버전) 설치
        • Quantum Espresso-6.6 (GPU 버전) 설치
        • Quantum Espresso-6.4 (GPU 버전) 설치
      • OpenFOAM-v1912 설치 소개 (SKL)
  • 2️⃣슈퍼컴퓨터 활용 팁
    • 공통
      • oneAPI 소개
      • AMD Instinct MI100 GPU 성능 테스트
      • Checkpoint 기능 관련 안내
      • 인터렉티브 작업 제출 예제
      • git 사용 방법 안내
      • PYTHON 2.7 EOL(End of Life) 안내
      • Conda 의 활용 소개
      • CPU 관련 오류 사항 ( illegal instruction )
      • vasp.5.4.4.18Apr17 Version Bug 이슈
      • 컴파일러별 AVX-512 옵션 정리
      • Linux(Unix) 에서 Text 파일 내용에 ^M 이 붙어 있는 경우 해결 방법
      • vasp.5.4.1.24Jun15 Version Bug 이슈
      • 오픈 소스 빌드 시에 OpenMP 체크 오류 (Intel 컴파일러)
      • X86_64 어셈블리 프로그래밍 기초
    • 누리온
      • MVAPICH2/MVAPICH2-X 성능 비교(VASP)
      • WRF
        • WRF 멀티노드 활용(SKL)
        • WRF 멀티노드 활용(KNL)
      • VASP
        • VASP 멀티노드 활용(SKL)
        • VASP 멀티노드 활용(KNL)
      • LAMMPS
        • LAMMPS 멀티노드 활용(SKL)
        • LAMMPS 멀티노드 활용(KNL)
      • Gromacs
        • Gromacs 멀티노드 활용 (SKL)
        • Gromacs 멀티노드 활용 (KNL)
      • QE
        • QE 멀티노드 활용(SKL)
        • QE 멀티노드 활용(KNL)
    • 뉴론
      • SSH Port Forwarding 을 통한 Jupyter 작업 실행
      • AMD 노드 활용
      • LAMMPS 멀티노드 활용
      • Gromacs 멀티노드 활용
      • OpenMPI 3.1.X 이슈 사항
      • MPI 환경설정 및 작업 제출 방법(2021.03)
  • 3️⃣동영상 지침서
    • 공통
      • 파일 전송 (FTP) 사용법
    • 누리온
      • 작업 제출 방법
      • 작업 스크립트 작성법
      • 슈퍼컴퓨터 모듈 사용법
      • 슈퍼컴퓨터 접속 방법 [Windows 사용자]
      • 슈퍼컴퓨터 접속 방법 [Mac 사용자]
    • 뉴론
      • 인터렉티브 작업 방법
      • Slurm 작업 제출 방법
      • conda 설정방법
      • 작업 스크립트 작성 방법
  • 4️⃣기타
    • 누리온
      • FAQ (2025.03)
      • 사용자 지침서 (2021.05)
      • 데스크톱 가상화(VDI)
      • TSMSF 사용자 지침서
      • i-PI 사용법 (LAMMPS)
      • 딥러닝 프레임워크 병렬화 사용법
      • Q-CHEM v5.2 사용자 지침서
      • ABAQUS 사용자 지침서(2020.12)
      • OpenFOAM 사용자 지침서
      • 가우시안16(Gaussian16) S/W 사용 안내 (2019.03)
      • ANSYS FLUENT 사용자 지침서(2020.03)
      • ANSYS CFX 사용자 지침서(2020.02)
      • NASTRAN 사용자 지침서(2020.02)
      • LS-DYNA 사용자 지침서(2020.02)
      • 가우시안16(Gaussian16) LINDA S/W 사용 안내 (2019.08)
    • 뉴론
      • 공유 노드 정책 변경에 따른 메모리 할당량 설정 안내
      • SLURM 스케줄러 Fairshare 스케줄링 정책
      • FAQ (2025.01)
      • OpenFOAM 사용자 지침서
      • Jupyter 사용자 지침서
      • 딥러닝 프레임워크 병렬화 사용법
      • Keras 기반 Multi GPU 사용 방법 (2020.10)
      • 가우시안16(Gaussian16) GPU S/W 사용 안내 (2019.08)
      • slurm 스케쥴러 기본 사용법 (2021.04)
      • 뉴론 시스템 개요(2021.04)
  • External Link
    • Nurion Guide(Eng)
    • Neuron Guide(Eng)
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SIESTA

SIESTA 프로그램 소개

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SIESTA(Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms)는 분자와 고체의 전자 구조 계산과 ab initio 분자 동역학 시뮬레이션을 효율적으로 수행하기 위한 프로그램입니다. 원자 궤도 기저를 활용하여 수천 원자 규모의 시스템에도 효율적으로 적용할 수 있으며 고체, 분자, 나노구조 등 다양한 물질의 전자적 특성을 정밀하게 예측하고 빠른 계산 속도와 높은 확장성을 제공하여 복잡한 물리 문제 해결에 유용한 프로그램 입니다.

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  • SIESTA 설치 문서

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https://siesta-project.org/siesta
SIESTA 4.1-b3 설치(KNL)
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