VASP 5.3.5 설치
슈퍼컴퓨팅인프라센터 2018. 12. 5. 18:24
KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 5.3.5 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.
가. 설치 환경
구분
내용
대상 시스템
누리온
OS Version
리눅스 / CentOS 7.3
CPU
Intel(R) Xeon(R) Gold 6148
컴파일러
Intel 2018.3 Version
MPI
IntelMPI 2018.3 Version
기타
Intel MKL Math Library
나. 설치 전 환경 설정
누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.
[환경 설정]
$ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3다. vasp 5.3.5 버전 설치 과정
설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.
[설치과정]
$ tar xvf vasp.5.lib.tar
$ tar xvf vasp.5.3.5.tar.gz
$ cd vasp.5.lib
$ cp makefile.linux_ifc_P4 makefile
$ vi makefile
- - - - - [vasp.5.lib makefile 파일 수정 내용] 참고
$ make
$ cd ../vasp.5.3
$ cp makefile.linux_ifc_P4 makefile
$ vi makefile
- - - - - [vasp.5.3 makefile 파일 수정 내용] 참고
$ make[vasp.5.lib makefile 파일 수정]
.SUFFIXES: .inc .f .F
# C-preprocessor
CPP = gcc -E -P -C $*.F >$*.f
FC=ifort
CFLAGS = -O
FFLAGS = -O0 -FI
FREE = -FR
DOBJ = preclib.o timing_.o derrf_.o dclock_.o diolib.o dlexlib.o drdatab.o
#-----------------------------------------------------------------------
# general rules
#-----------------------------------------------------------------------
libdmy.a: $(DOBJ) lapack_double.o linpack_double.o lapack_atlas.o
-rm libdmy.a
ar vq libdmy.a $(DOBJ)
# files which do not require autodouble
lapack_min.o: lapack_min.f
$(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c lapack_min.f
lapack_double.o: lapack_double.f
$(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c lapack_double.f
lapack_single.o: lapack_single.f
$(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c lapack_single.f
lapack_atlas.o: lapack_atlas.f
$(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c lapack_atlas.f
linpack_double.o: linpack_double.f
$(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c linpack_double.f
linpack_single.o: linpack_single.f
$(FC) $(FFLAGS) $(NOFREE) -c linpack_single.f
.c.o:
$(CC) $(CFLAGS) -c $*.c
.F.o:
$(CPP)
$(FC) $(FFLAGS) $(FREE) $(INCS) -c $*.f
.F.f:
$(CPP)
.f.o:
$(FC) $(FFLAGS) $(FREE) $(INCS) -c $*.f[vasp.5.3 makefile 파일 수정 내용]
.SUFFIXES: .inc .f .f90 .F
SUFFIX=.f90
FC=mpiifort
FCL=$(FC)
CPP_=fpp -f_com=no -free -w0 $*.F $*$(SUFFIX)
FFLAGS = -FR -assume byterecl
OFLAG=-O3 -ip -ftz -xCORE-AVX2
OFLAG_HIGH = $(OFLAG)
OBJ_HIGH =
OBJ_NOOPT =
DEBUG = -FR -O0
INLINE = $(OFLAG)
MKL_PATH=$(MKLROOT)/lib/intel64
BLAS= -mkl=cluster
BLACS =
SCALAPACK =
CPP= $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \
-DCACHE_SIZE=16000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \
-DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \
-DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV
LIB = -L../vasp.5.lib -ldmy \
../vasp.5.lib/linpack_double.o \
$(BLAS) $(SCALAPACK)
LINK = -shared-intel
INCS= -I$(MKLROOT)/include/fftw
FFT3D= fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o \
$(MKLROOT)/lib/intel64/libfftw3xf_intel.a
BASIC= symmetry.o symlib.o lattlib.o random.o
SOURCE= base.o mpi.o smart_allocate.o xml.o \
constant.o jacobi.o main_mpi.o scala.o \
asa.o lattice.o poscar.o ini.o mgrid.o xclib.o vdw_nl.o xclib_grad.o \
radial.o pseudo.o gridq.o ebs.o \
mkpoints.o wave.o wave_mpi.o wave_high.o spinsym.o \
$(BASIC) nonl.o nonlr.o nonl_high.o dfast.o choleski2.o \
mix.o hamil.o xcgrad.o xcspin.o potex1.o potex2.o \
constrmag.o cl_shift.o relativistic.o LDApU.o \
paw_base.o metagga.o egrad.o pawsym.o pawfock.o pawlhf.o rhfatm.o hyperfine.o paw.o \
mkpoints_full.o charge.o Lebedev-Laikov.o stockholder.o dipol.o pot.o \
dos.o elf.o tet.o tetweight.o hamil_rot.o \
chain.o dyna.o k-proj.o sphpro.o us.o core_rel.o \
aedens.o wavpre.o wavpre_noio.o broyden.o \
dynbr.o hamil_high.o rmm-diis.o reader.o writer.o tutor.o xml_writer.o \
brent.o stufak.o fileio.o opergrid.o stepver.o \
chgloc.o fast_aug.o fock_multipole.o fock.o mkpoints_change.o sym_grad.o \
mymath.o internals.o npt_dynamics.o dynconstr.o dimer_heyden.o dvvtrajectory.o subdftd3.o \
vdwforcefield.o nmr.o pead.o subrot.o subrot_scf.o paircorrection.o \
force.o pwlhf.o gw_model.o optreal.o steep.o davidson.o david_inner.o \
electron.o rot.o electron_all.o shm.o pardens.o \
optics.o constr_cell_relax.o stm.o finite_diff.o elpol.o \
hamil_lr.o rmm-diis_lr.o subrot_cluster.o subrot_lr.o \
lr_helper.o hamil_lrf.o elinear_response.o ilinear_response.o \
linear_optics.o \
setlocalpp.o wannier.o electron_OEP.o electron_lhf.o twoelectron4o.o \
gauss_quad.o m_unirnk.o minimax_tabs.o minimax.o \
mlwf.o ratpol.o screened_2e.o wave_cacher.o chi_base.o wpot.o \
local_field.o ump2.o ump2kpar.o fcidump.o ump2no.o \
bse_te.o bse.o acfdt.o chi.o sydmat.o \
lcao_bare.o wnpr.o dmft.o \
rmm-diis_mlr.o linear_response_NMR.o wannier_interpol.o linear_response.o auger.o getshmem.o \
dmatrix.o
vasp: $(SOURCE) $(FFT3D) $(INC) main.o
rm -f vasp
$(FCL) -o vasp main.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB) $(LINK)
makeparam: $(SOURCE) $(FFT3D) makeparam.o main.F $(INC)
$(FCL) -o makeparam $(LINK) makeparam.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB)
zgemmtest: zgemmtest.o base.o random.o $(INC)
$(FCL) -o zgemmtest $(LINK) zgemmtest.o random.o base.o $(LIB)
dgemmtest: dgemmtest.o base.o random.o $(INC)
$(FCL) -o dgemmtest $(LINK) dgemmtest.o random.o base.o $(LIB)
ffttest: base.o smart_allocate.o mpi.o mgrid.o random.o ffttest.o $(FFT3D) $(INC)
$(FCL) -o ffttest $(LINK) ffttest.o mpi.o mgrid.o random.o smart_allocate.o base.o $(FFT3D) $(LIB)
kpoints: $(SOURCE) $(FFT3D) makekpoints.o main.F $(INC)
$(FCL) -o kpoints $(LINK) makekpoints.o $(SOURCE) $(FFT3D) $(LIB)
clean:
-rm -f *.g *.f90 *.o *.L *.mod ; touch *.F
main.o: main$(SUFFIX)
$(FC) $(FFLAGS) $(DEBUG) $(INCS) -c main$(SUFFIX)
xcgrad.o: xcgrad$(SUFFIX)
$(FC) $(FFLAGS) $(INLINE) $(INCS) -c xcgrad$(SUFFIX)
xcspin.o: xcspin$(SUFFIX)
$(FC) $(FFLAGS) $(INLINE) $(INCS) -c xcspin$(SUFFIX)
makeparam.o: makeparam$(SUFFIX)
$(FC) $(FFLAGS) $(DEBUG) $(INCS) -c makeparam$(SUFFIX)
makeparam$(SUFFIX): makeparam.F main.F
base.o: base.inc base.F
mgrid.o: mgrid.inc mgrid.F
constant.o: constant.inc constant.F
lattice.o: lattice.inc lattice.F
setex.o: setexm.inc setex.F
pseudo.o: pseudo.inc pseudo.F
mkpoints.o: mkpoints.inc mkpoints.F
wave.o: wave.F
nonl.o: nonl.inc nonl.F
nonlr.o: nonlr.inc nonlr.F
$(OBJ_HIGH):
$(CPP)
$(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG_HIGH) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
$(OBJ_NOOPT):
$(CPP)
$(FC) $(FFLAGS) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
fft3dlib_f77.o: fft3dlib_f77.F
$(CPP)
$(F77) $(FFLAGS_F77) -c $*$(SUFFIX)
.F.o:
$(CPP)
$(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
.F$(SUFFIX):
$(CPP)
$(SUFFIX).o:
$(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
# special rules
#-----------------------------------------------------------------------
# these special rules have been tested for ifc.11 and ifc.12 only
fft3dlib.o : fft3dlib.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX)
fft3dfurth.o : fft3dfurth.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
fftw3d.o : fftw3d.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O1 $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
fftmpi.o : fftmpi.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
fftmpiw.o : fftmpiw.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O1 $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
wave_high.o : wave_high.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
# the following rules are probably no longer required (-O3 seems to work)
wave.o : wave.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX)
paw.o : paw.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
cl_shift.o : cl_shift.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX)
us.o : us.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
LDApU.o : LDApU.F
$(CPP)
$(FC) -FR -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX)Last updated