VASP 5.4.4 설치 (KNL버전)

슈퍼컴퓨팅인프라센터 2018. 11. 29. 09:39

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 vasp 5.4.4 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.

가. 설치 환경

구분	내용
대상 시스템	누리온
OS Version	리눅스 / CentOS 7.3
CPU	Intel(R) Xeon Phi(TM) CPU 7250
컴파일러	Intel 2018.3 Version
MPI	IntelMPI 2018.3 Version
기타	Intel MKL Math Library

나. 설치 전 환경 설정

누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.

[ 환경 설정 ]

$ module load intel/18.0.3 impi/18.0.3

다. vasp 5.4.4 버전 설치 과정

설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.

[설치과정]

$ tar xvzf vasp.5.4.4.tar.gz
$ cd vasp.5.4.4
$ cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include
$ vi makefile.include
- - - - - [ makefile.include 파일 수정 내용] 참고
$ make all

[make.include 파일 수정 내용]

ADDITIONAL_OPTS=-O3 -qopenmp -xMIC-AVX512 -align array64byte
ADDITIONAL_OPTS_CC=-O3 -qopenmp -xMIC-AVX512

# Precompiler options
CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC15_impi\" \
-DCACHE_SIZE=12000 -Davoidalloc \
-DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \
-DnoAugXCmeta -Duse_bse_te \
-Dtbdyn \
-D_OPENMP -DPROFILING -Duse_shmem \
-Dshmem_bcast_buffer -Dsheme_rproj
CPP = fpp -f_com=no -free -w0 $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)
FC = mpiifort -qopenmp -mkl=parallel ${ADDITIONAL_OPTS}
FCL = mpiifort -mkl=parallel ${ADDITIONAL_OPTS}
FREE = -free -names lowercase
FFLAGS = -assume byterecl
OFLAG = ${ADDITIONAL_OPTS}
OFLAG_IN = $(OFLAG)
DEBUG = -O0
MKL_PATH = $(MKLROOT)/lib/intel64
BLAS =
LAPACK =
BLACS =
SCALAPACK =
OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o
INCS =-I$(MKLROOT)/include/fftw
LLIBS = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS)
OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o

# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB = $(CPP)
FC_LIB = $(FC)
CC_LIB = icc
CFLAGS_LIB = -O
FFLAGS_LIB = ${ADDITIONAL_OPTS}
FREE_LIB = $(FREE)
OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o

# For the parser library
CXX_PARS = icpc
LIBS += parser
LLIBS += -Lparser -lparser -lstdc++

# Normally no need to change this
SRCDIR = ../../src
BINDIR = ../../bin
#================================================
# GPU Stuff
CPP_GPU = -DCUDA_GPU -DRPROMU_CPROJ_OVERLAP -DUSE_PINNED_MEMORY -DCUFFT_MIN=28 -UscaLAPACK
OBJECTS_GPU = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d_gpu.o fftmpiw_gpu.o
CC = icc
CXX = icpc
CFLAGS = -fPIC -DADD_ -Wall -openmp -DMAGMA_WITH_MKL -DMAGMA_SETAFFINITY -DGPUSHMEM=300 -DHAVE_CUBLAS
CUDA_ROOT ?= /usr/local/cuda/
NVCC := $(CUDA_ROOT)/bin/nvcc -ccbin=icc
CUDA_LIB := -L$(CUDA_ROOT)/lib64 -lnvToolsExt -lcudart -lcuda -lcufft -lcublas
GENCODE_ARCH := -gencode=arch=compute_30,code=\"sm_30,compute_30\" \
-gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \
-gencode=arch=compute_60,code=\"sm_60,compute_60\"
MPI_INC = $(I_MPI_ROOT)/include64/