UPPV3.1 설치 소개

슈퍼컴퓨팅인프라센터 2019. 1. 7. 13:59

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 누리온 시스템에 UPPV3.1 Source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.

가. 설치 환경

구분	내용
대상 시스템	누리온
OS Version	리눅스 / CentOS 7.3
CPU	Intel(R) Xeon(R) Gold 6126
컴파일러	Intel 2018.3 Version
MPI	IntelMPI 2018.3 Version
기타	WRFV3.9.1.1

나. 설치 전 환경 설정

누리온 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 환경설정 툴인 Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.

[ 환경 설정 ]

$ module load craype-x86-skylake intel/18.0.3 impi/18.0.3
$ module load hdf4/4.2.13 hdf5/1.10.2 netcdf/4.6.1 ncl/6.5.0
$ export JASPERLIB=/apps/common/jasper/1.900.29/lib
$ export JASPERINC=/apps/common/jasper/1.900.29/include

다. 설치 과정

설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.

[설치과정]

$ tar xvzf DTC_upp_v3.1.tar.gz
$ cd UPPV3.1
$ ./configure
- - - - - [configure 과정 진행 내용] 참고
$ vi configure.upp
- - - - - [configure.upp 파일 수정 수정 내용] 참고
$ ./compile

※ UPP는 WRF 경로 설정을 별도로 하지 않기 위하여 아래와 같이 WRF와 동일 경로 상에 설치 하였다. 만약 다른 경로에 WRF 가 있다면 WRF_DIR 설정이 필요함.

[configure 과정 진행 내용]

$ ./configure
Will use NETCDF in dir: /apps/compiler/intel/18.0.3/applib1/mic-knl/netcdf/4.6.1
Will use WRF in dir: /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/../WRFV3
configure: making ./bin
bindir /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/bin
configure: making ./include
incmod /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/include
configure: making ./lib
libdir /scratch/optpar02/install_test/WRF/UPPV3.1/lib
JASPER Environent found :: GRIB2 library ::
grib2lib = -L/apps/common/jasper/1.900.29/lib -lpng -lz -ljasper
grib2inc = -I/apps/common/jasper/1.900.29/include
-------------------------------------------------------------------------
Please select from among the following supported platforms.
1. Linux x86_64, PGI compiler (serial)
2. Linux x86_64, PGI compiler (dmpar)
3. Linux x86_64, Intel compiler (serial)
4. Linux x86_64, Intel compiler (dmpar)
5. Linux x86_64, Intel compiler, SGI MPT (serial)
6. Linux x86_64, Intel compiler, SGI MPT (dmpar)
7. Linux x86_64, gfortran compiler (serial)
8. Linux x86_64, gfortran compiler (dmpar)
9. Linux x86_64, Intel compiler, IBM POE (serial)
10. Linux x86_64, Intel compiler, IBM POE (dmpar)
11. Linux x86_64, gfortran compiler: -f90=gfortran (serial)
12. Linux x86_64, gfortran compiler: -f90=gfortran (dmpar)
13. Linux x86_64, PGI compiler: -f90=pgf90 (serial)
14. Linux x86_64, PGI compiler: -f90=pgf90 (dmpar)
Enter selection [1-14] : 4
-------------------------------------------------------------------------
Configuration successful. To build the UPP, type: compile
-------------------------------------------------------------------------

[configure.upp 파일 수정 수정 내용]

DM_FC = mpiifort
DM_F90 = mpiifort -free
DM_CC = mpiicc
FOPT = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512
CRTMOPT = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512
COPT = -O3 -fPIC -xCOMMON-AVX512
GRIB2SUPT_LIB = -L/apps/common/jasper/1.900.29/lib -L/apps/common/libpng/1.2.56/lib -lpng -lz -ljasper
GRIB2SUPT_INC = -I/apps/common/jasper/1.900.29/include -I/apps/common/libpng/1.2.56/include

※ 누리온 시스템 설치 예제는 SKL/KNL 계산노드에서 공통적으로 사용을 위해 "-xCOMMON-AVX512" 로 작성

- SKL(skylake) 노드 전용 : -xCORE-AVX512 - KNL(Intel Xeon Phi Knights Landing) 전용 : -xMIC-AVX512 - SKL 과 KNL 공통 적용 : -xCOMMON-AVX512 - 참고 : https://software.intel.com/en-us/articles/compiling-for-the-intel-xeon-phi-processor-and-the-intel-avx-512-isa