KISTI 슈퍼컴퓨터센터의 누리온 시스템에 siesta-4.1-b3 source 버전으로 설치 하는 방법에 대하여 소개 한다.
가. 설치 환경
나. 설치 전 환경 설정
KISTI 시스템은 PATH, LD_LIBRARY_PATH 등을 쉽게 하기 위하여 OpenSource 인 Environment Modules(http://modules.sourceforge.net)이 구성되어 있고, 이하 설치 소개 에서는 module load를 이용한 환경 설정 방법을 이용한다.
설치 과정 소개는 tar 를 이용한 압축 해제 방법과 설정 방법등 진행 절차를 위주로 설명하고, 소스 파일 다운로드 등은 생략한다.
[설치과정]
$ tar -xvf siesta-4.1-b3.tar.gz
$ cd siesta-4.1-b3
$ cd Obj
$ sh ../Src/obj_setup.sh
$ cp intel.make arch.make
$ vi arch.make 수정
- - - [arch.make 파일 수정 내용] 참고 - - -
$ make
[arch.make 파일 수정 내용]
## Copyright (C) 1996-2016 The SIESTA group# This file is distributed under the terms of the# GNU General Public License: see COPYING in the top directory# or http://www.gnu.org/copyleft/gpl.txt.# See Docs/Contributors.txt for a list of contributors.##-------------------------------------------------------------------# arch.make file for gfortran compiler.# To use this arch.make file you should rename it to# arch.make# or make a sym-link.# For an explanation of the flags see DOCUMENTED-TEMPLATE.make.SUFFIXES:.SUFFIXES: .f .F .o .c .a .f90 .F90SIESTA_ARCH = unknownCC = mpiiccFPP =$(FC) -E -PFC = mpiifortFC_SERIAL = ifortFFLAGS = -O2 -fPICAR = arRANLIB = ranlibSYS = nagSP_KIND = 4DP_KIND = 8KINDS =$(SP_KIND)$(DP_KIND)LDFLAGS = -mkl=clusterCOMP_LIBS = libsiestaLAPACK.a libsiestaBLAS.aFPPFLAGS =$(DEFS_PREFIX)-DFC_HAVE_ABORTMPI_INTERFACE = libmpi_f90.aMPI_INCLUDE = .FPPFLAGS += -DMPILIBS = -mkl=cluster -L/apps/compiler/intel/17.0.5/impi/17.0.5/applib2/mic-knl/netcdf-hdf5-parallel/4.6.1/lib -lnetcdf# Dependency rules ---------FFLAGS_DEBUG = -g -O1 # your appropriate flags here...# The atom.f code is very vulnerable. Particularly the Intel compiler# will make an erroneous compilation of atom.f with high optimization# levels.atom.o: atom.F$(FC) -c $(FFLAGS_DEBUG)$(INCFLAGS)$(FPPFLAGS)$(FPPFLAGS_fixed_F) $<pdos2k.o: pdos2k.F$(FC) -c $(INCFLAGS)$(FPPFLAGS)$(FPPFLAGS_fixed_F) $<pdos3k.o: pdos3k.F$(FC) -c $(INCFLAGS)$(FPPFLAGS)$(FPPFLAGS_fixed_F) $<.c.o:$(CC) -c $(CFLAGS)$(INCFLAGS)$(CPPFLAGS) $<.F.o:$(FC) -c $(FFLAGS)$(INCFLAGS)$(FPPFLAGS)$(FPPFLAGS_fixed_F) $<.F90.o:$(FC) -c $(FFLAGS)$(INCFLAGS)$(FPPFLAGS)$(FPPFLAGS_free_F90) $<.f.o:$(FC) -c $(FFLAGS)$(INCFLAGS)$(FCFLAGS_fixed_f) $<.f90.o:$(FC) -c $(FFLAGS)$(INCFLAGS)$(FCFLAGS_free_f90) $<